航空服务系是学校重点建设的特色系部，现开设航空服务、民航运输服务2个专业，共设19个教学班级，在校学生950人。系部教学场所位于腾飞楼前楼，实训场所设在启航楼前楼的航空服务实训基地，建有2个功能完善的航空模拟舱，配备民航客票销售、值机、安检、广播等全套实训系统。2024年，学校从天津航空公司引进空客A320实体飞机，建成飞机综合实训基地，为学生提供真实飞机机体检查、系统维护、部件拆装等实操训练条件。
系部与乌鲁木齐机场、石河子花园机场建立稳定合作关系，学生在校期间可进入机场一线岗位实习，实现“入学即入职、上课即上岗”的培养目标。毕业生主要分布在疆内各大机场及交通运输领域，成为新疆航空服务业的中坚力量。航空服务系秉承“德技并修、工学结合”的培养理念，致力于培养品德高、技能强、素质好的航空服务专业人才。
